Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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Col5a3Q9JLI2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Col5a3Q9JLI2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Col5a3Q9JLI2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Col5a3Q9JLI2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Col5a3Q9JLI2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Col5a3Q9JLI2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Col5a3Q9JLI2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Col5a3Q9JLI2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Col5a3Q9JLI2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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Col5a3Q9JLI2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Col5a3Q9JLI2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Col5a3Q9JLI2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Col5a3Q9JLI2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Col5a3Q9JLI2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Col5a3Q9JLI2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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