Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms