Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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