Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms