Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms