Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms