Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tuba8Q9JJZ2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tuba8Q9JJZ2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tuba8Q9JJZ2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tuba8Q9JJZ2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms