Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MkksQ9JI70 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MkksQ9JI70 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MkksQ9JI70 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MkksQ9JI70 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MkksQ9JI70 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MkksQ9JI70 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MkksQ9JI70 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MkksQ9JI70 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MkksQ9JI70 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms