Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms