Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trim39Q9ESN2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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