Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn2Q9ER65 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms