Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms