Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlr1Q9EPQ1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms