Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD19

Rassf7, Ras association domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf7Q9DD19 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rassf7Q9DD19 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rassf7Q9DD19 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms