Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn3Q9DCB1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn3Q9DCB1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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