Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1dQ9DC28 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms