Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms