Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms