Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd2Q9D8U0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd2Q9D8U0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd2Q9D8U0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd2Q9D8U0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd2Q9D8U0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd2Q9D8U0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd2Q9D8U0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd2Q9D8U0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd2Q9D8U0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd2Q9D8U0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms