Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms