Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Derl3Q9D8K3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms