Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms