Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms