Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms