Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms