Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc39Q9D5Y1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms