Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc6Q9D4E6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms