Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms