Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf146Q9CZW6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf146Q9CZW6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms