Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snf8Q9CZ28 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms