Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Bud23Q9CY21 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Bud23Q9CY21 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Bud23Q9CY21 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Bud23Q9CY21 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Bud23Q9CY21 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Bud23Q9CY21 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Bud23Q9CY21 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Bud23Q9CY21 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Bud23Q9CY21 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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