Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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