Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms