Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms