Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gkn2Q9CQS6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gkn2Q9CQS6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gkn2Q9CQS6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gkn2Q9CQS6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gkn2Q9CQS6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gkn2Q9CQS6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn2Q9CQS6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms