Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms