Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms