Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms