Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms