Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pagr1aQ99L02 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms