Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmed9Q99KF1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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