Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms