Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lims1Q99JW4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lims1Q99JW4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lims1Q99JW4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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