Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms