Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi2Q920Q6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi2Q920Q6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi2Q920Q6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi2Q920Q6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi2Q920Q6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi2Q920Q6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi2Q920Q6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi2Q920Q6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms