Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarca5Q91ZW3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms