Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek8Q91ZR4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nek8Q91ZR4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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