Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms