Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms