Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l3Q91XE9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l3Q91XE9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms